Pokaż wiadomości
Strony: [1]
1  Koło Naukowe / Portal z zadaniami / Odp: Enzymy restrykcyjne : Maja 12, 2015, 08:43:39
Pytanie: czy ja mam dzielić to zadanie na trzy, żeby nie było problemów z miejscem na odpowiedzi? czy rozwiązać to jakoś inaczej?
2  Koło Naukowe / Portal z zadaniami / Odp: Enzymy restrykcyjne : Kwietnia 06, 2015, 11:03:05
posiłkowałam się prawdę mówiąc wikipedią i kilkoma innymi stronami, żeby to brzmiało rozsądnie i nic nie było o RNA napisane. Ale chyba masz rację, poprawię.
3  Koło Naukowe / Portal z zadaniami / Odp: Enzymy restrykcyjne : Kwietnia 04, 2015, 01:28:52
Enzymy restrykcyjne (restryktazy) to enzymy przecinające nić #DNA (lub RNA) w obszarach, w których występują specyficzne, krótkie sekwencje #nukleotydowe.Organizmy #prokariotyczne używają ich do obrony przed infekcją przez bakteriofagi. Dzięki enzymom restrykcyjnym bakterie mogą rozcinać i unieszkodliwiać wnikający do komórki DNA bakteriofaga.
Restryktazy zwykle tną DNA wewnątrz rozpoznawanej przez nie sekwencji, zostawiając tzw "#lepkie końce", jednak dla uproszczenia zadania przyjmijmy, że enzym restrykcyjny rozpoznaje specyficzny fragment sekwencji DNA i tnie nić tuż za nim.

 sekwencja: <plik z długą sekwencją>
   specyficzna sekwencja rozpoznawalna przez enzym restrykcyjny: GAATTC

1) Napisz program, który policzy na ile części zostanie podzielona sekwencja po działaniu na nią enzymami restrykcyjnymi.


2) Napisz program, który policzy średnią długość (średnią ilość par zasad) fragmentów sekwencji po poprzecinaniu enzymami restrykcyjnymi.

3) Napisz program, który policzy na ile fragmentów zostanie podzielona sekwencja, jeśli specyficzna sekwencja rozpoznawalna przez enzym restrykcyjny to : G[AG][TC]C
  ( gdzie '[AG]' oznacza, że w tym miejscu może stać A lub G)



<<ciekawostka>>
Zastosowanie enzymów restrykcyjnych:

    ·sporządzanie map genów
    ·izolacja oraz identyfikacja genów
    ·sekwencjonowanie DNA
    ·porównywanie DNA (pochodzących z różnych organizmów)
    ·rekombinowanie i klonowanie genów (lub fragmentów genów)
    ·diagnostyka (chorób genetycznych, niektórych chorób nowotworowych, chorób infekcyjnych)
    ·zastosowanie w medycynie : ustalanie zgodności tkankowej – niezbędnej w transplantologii, do ustalania pokrewieństwa



Ta ciekawostka może nie jest szczególnie ciekawostkowa, ale ktoś może chceć wiedzieć "do czego to potrzebne", więc możemy dać jakąś taką informację.
Zadanie można podzielić na kilka zadań lub zostawić je jako zadanie z kilkoma podpunktami.
Można sekwencję podać w pliku do pobrania i dodać do zadania element "napisz program, który pobiera dane z pliku..."
plik mam, mogę udostępnić jeśli jest potrzeba, lub wrzucić odrazu na strone przy wrzucaniu na stronę.
4  Koło Naukowe / Portal z zadaniami / bardzo_proste_zadania : Marca 21, 2015, 05:52:06
Czy zamierzamy też mieć jakieś bardzo proste zadania, takie dla początkujących? Coś w stylu tych które mieliśmy na WDI?
5  Koło Naukowe / Portal z zadaniami / Odp: Nazwa portalu : Marca 21, 2015, 05:46:35
Czy to się już będzie nazywało "da vinci koduje" ? nie brzmi to zbyt dumnie :<
6  Koło Naukowe / Portal z zadaniami / Odp: Enzymy restrykcyjne : Marca 08, 2015, 04:39:05
to brzmi jak materiał na kilka nie-bardzo-trudnych zadań (lub wieloetapowe zadanie), wezmę.
Strony: [1]

SimplePortal 2.3.1 © 2008-2009, SimplePortal